当黄杨幼苗主茎形成后，溃疡病、枯梢病，瘤病等便逐渐发展起来。幼苗的茎部病害往往伴随着大叶黄杨叶部凋萎、变黄等症状，有时发育成多顶苗。当病斑环绕苗茎一周时，病斑以上部分，甚至全株死亡。由于幼苗茎部纤细，很易被环切，因此茎部病害易于造成死苗或废苗。
大多叶部病害也延伸至嫩枝或幼茎。
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